Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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