Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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ECM1Q16610 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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ECM1Q16610 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
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