Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNXAQ16473 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms