Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms