Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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