Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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VAMP3Q15836 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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VAMP3Q15836 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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VAMP3Q15836 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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VAMP3Q15836 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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VAMP3Q15836 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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