Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCLAFQ15004 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCLAFQ15004 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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