Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EPB41L2-212ENST00000526333 549 ntTSL 55.93□□□□□ -1.462e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 VIRMA-204ENST00000519001 460 ntTSL 35.77□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SENP6-208ENST00000483859 1013 ntTSL 35.71□□□□□ -1.52e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.532e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CCDC88A-203ENST00000412148 2880 ntTSL 1 (best)5.46□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SNX2-209ENST00000510372 1412 ntTSL 25.28□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.582e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SENP6-203ENST00000424947 2685 ntTSL 25.07□□□□□ -1.62e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CCDC88A-209ENST00000456975 2208 ntTSL 24.74□□□□□ -1.652e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 WDHD1-205ENST00000567693 2348 ntTSL 24.29□□□□□ -1.722e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)3.58□□□□□ -1.842e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CCDC88A-205ENST00000426576 4500 ntTSL 1 (best)3.47□□□□□ -1.852e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CIZ1-220ENST00000485862 843 ntTSL 216.1■□□□□ 0.172e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-202ENST00000460563 1045 ntTSL 511.74□□□□□ -0.533e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-204ENST00000464888 565 ntTSL 210.96□□□□□ -0.653e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CIZ1-210ENST00000461765 677 ntTSL 39.9□□□□□ -0.822e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-203ENST00000463817 853 ntTSL 28.66□□□□□ -1.023e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-206ENST00000467700 932 ntTSL 28.46□□□□□ -1.063e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-208ENST00000479815 1030 ntTSL 58□□□□□ -1.133e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.283e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-207ENST00000468388 320 ntTSL 37.06□□□□□ -1.283e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.383e-7■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.914e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.094e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.544e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SRPK2-213ENST00000485455 436 ntTSL 34.35□□□□□ -1.714e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.382e-6■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PLK1-202ENST00000562272 4135 ntTSL 211.17□□□□□ -0.622e-6■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SYF2-203ENST00000474160 438 ntTSL 219.26■□□□□ 0.678e-18■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 GPX4-209ENST00000593032 583 ntTSL 318.03■□□□□ 0.484e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 514.09□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 MDN1-203ENST00000468568 538 ntTSL 33.91□□□□□ -1.786e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PGGHG-206ENST00000476372 2879 ntTSL 215.14■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.453e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-207ENST00000579733 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-211ENST00000582208 625 ntTSL 310.57□□□□□ -0.721e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-208ENST00000581089 697 ntTSL 210.28□□□□□ -0.761e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-210ENST00000581440 943 ntTSL 310.28□□□□□ -0.761e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.811e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-209ENST00000581185 1900 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.821e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 BAZ2A-205ENST00000547650 614 ntTSL 39.61□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-205ENST00000487603 1898 ntTSL 29.59□□□□□ -0.871e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-204ENST00000470450 1872 ntTSL 1 (best)9.46□□□□□ -0.93e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-212ENST00000626972 1862 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.983e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-204ENST00000467843 4187 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.071e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-210ENST00000496121 1326 ntTSL 27.69□□□□□ -1.183e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CCT8-203ENST00000432178 556 ntTSL 25.64□□□□□ -1.513e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-212ENST00000583096 834 ntTSL 35.35□□□□□ -1.551e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 WSB1-216ENST00000584114 479 ntTSL 33.61□□□□□ -1.831e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 DOT1L-206ENST00000482433 3658 ntTSL 211.61□□□□□ -0.556e-8■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CSDE1-210ENST00000525878 626 ntTSL 46.99□□□□□ -1.296e-8■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 CSDE1-211ENST00000525970 503 ntTSL 46.08□□□□□ -1.446e-8■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.065e-10■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 NAA15-207ENST00000496716 677 ntTSL 37.04□□□□□ -1.285e-8■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 YBX1-202ENST00000332220 776 ntTSL 520.69■□□□□ 0.92e-30■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.842e-30■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SERBP1-207ENST00000490406 624 ntTSL 513.95□□□□□ -0.188e-13■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 EIF1-206ENST00000586699 572 ntTSL 25.41□□□□□ -1.544e-10■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PTMS-206ENST00000540874 501 ntTSL 219.34■□□□□ 0.697e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.039e-44■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PIEZO1-212ENST00000497793 1228 ntTSL 221.07■□□□□ 0.968e-11■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PIEZO1-211ENST00000495568 901 ntTSL 210.65□□□□□ -0.78e-11■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PIEZO1-204ENST00000466823 584 ntTSL 28.88□□□□□ -0.998e-11■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 UBR4-208ENST00000459947 3873 ntTSL 210.73□□□□□ -0.692e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 AL137127.1-201ENST00000606379 3402 ntBASIC10.38□□□□□ -0.752e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 UBR4-214ENST00000486515 536 ntTSL 37.38□□□□□ -1.232e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.261e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.761e-9■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 PRRC2C-209ENST00000480806 299 ntTSL 59.21□□□□□ -0.941e-12■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 EPRS-204ENST00000477030 1526 ntTSL 1 (best)21.47■■□□□ 1.037e-14■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.942e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-219ENST00000532780 1194 ntTSL 217.28■□□□□ 0.362e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-210ENST00000527387 579 ntTSL 415.14■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-206ENST00000525624 1048 ntTSL 513.48□□□□□ -0.252e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 ELOA-203ENST00000609199 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 TSC22D1-201ENST00000261489 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.092e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.172e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.172e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-216ENST00000532167 570 ntTSL 46.64□□□□□ -1.352e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-205ENST00000525463 583 ntTSL 54.57□□□□□ -1.682e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 HSPA8-223ENST00000534567 588 ntTSL 44.38□□□□□ -1.712e-7■□□□□ 8.8
PUM1Q14671 SRRM2-228ENST00000576878 1141 ntTSL 217.3■□□□□ 0.361e-44■□□□□ 8.8
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 266.4 ms