Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HNF4GQ14541 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms