Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIDRQ14159 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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