Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DDX39BQ13838 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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