Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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