Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALCAMQ13740 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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