Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAMK2DQ13557 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAMK2DQ13557 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms