Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XRCC4Q13426 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XRCC4Q13426 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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