Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TARBP1Q13395 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TARBP1Q13395 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms