Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPS1Q13098 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms