Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTP4A2Q12974 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTP4A2Q12974 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTP4A2Q12974 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTP4A2Q12974 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTP4A2Q12974 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTP4A2Q12974 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTP4A2Q12974 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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