Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
STX4Q12846 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
STX4Q12846 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms