Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD300CQ08708 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms