Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FMODQ06828 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FMODQ06828 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FMODQ06828 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FMODQ06828 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms