Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms