Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC2Q02487 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms