Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms