Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTBSQ01459 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBSQ01459 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms