Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms