Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MPP1Q00013 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms