Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms