Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMF1P82094 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMF1P82094 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMF1P82094 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMF1P82094 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMF1P82094 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMF1P82094 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMF1P82094 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TMF1P82094 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMF1P82094 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMF1P82094 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMF1P82094 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMF1P82094 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms