Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IL13RA1P78552 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IL13RA1P78552 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms