Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTG1P63261 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms