Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF6P62330 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms