Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TMEM258P61165 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms