Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB2AP61019 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB2AP61019 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms