Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVPABLB-1P60509 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms