Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms