Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms