Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA4P54764 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms