Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP98P52948 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP98P52948 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP98P52948 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP98P52948 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP98P52948 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP98P52948 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP98P52948 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP98P52948 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms