Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FNTBP49356 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FNTBP49356 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
FNTBP49356 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms