Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms