Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK1P39086 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms