Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZEB1P37275 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms