Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
THBS4P35443 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
THBS4P35443 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
THBS4P35443 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
THBS4P35443 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms