Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPIFP30405 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPIFP30405 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PPIFP30405 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPIFP30405 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPIFP30405 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPIFP30405 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPIFP30405 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPIFP30405 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms