Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms