Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSFA2P28290 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSFA2P28290 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms