Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA3P25788 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA3P25788 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms