Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTAFRP25105 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms