Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAMP1P23763 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms